Kolonoskopie v celkové anestezii
Vyzývá se studie střeva za použití dlouhého flexibilního přístroje vybaveného mikroskopickou videokamerou kolonoskopie . Tento postup je ve většině případů pro pacienta naprosto nepříjemný a někdy i bolestivý kvůli potřebě zavést kolonoskop do konečníku a přemístit ho do kopule céka, zatímco současně vstříkne vzduch do dutiny orgánu. Proto se v moderních klinikách nejčastěji provádí kolonoskopie za anestezie. Existuje pouze 3 typy premedikací - lokální, celková anestezie a sedace.
Kolonoskopie s lokální anestezií
Tato metoda anestézie spočívá v tom, že se anus a špička kolonoskopu zpracují lokálními anestetiky.
Tato technika je praktikována všude, ale pacienti jsou zřídka uvítáni. Taková anestezie jen lehce vyhlazuje bolestivost postupu, ale pocit nepohodlí se projevuje v plném rozsahu během studie střev. Zvláště nepříjemné pocity vznikají, pokud během kolonoskopie lékař provádí biopsii zjištěných nádorů nebo polypy , odtrhávání části růstu.
Do kolonoskopie pod celkovou anestézou?
Tato technika předepisování poskytuje absolutní pohodlí pacienta, protože jeho vědomí je během postupu zcela deprimováno.
Navzdory zdánlivé přitažlivosti popsané metody anestézie je s ní spojeno mnoho nebezpečí. Faktem je, že celková anestézie zvyšuje riziko vzniku těžkých komplikací samotné kolonoskopie a anestézie. Navíc vzniká řada potíží z důvodu potřeby neustále sledovat stav pacienta. Proto se provádí diagnostika s použitím obecné premedikace 
pracující s přípravou veškerého vybavení, které může být požadováno v případě nepředvídaných komplikací události.
Kolonoskopie s částečnou anestezií
Doporučená a nejlepší volba pro anestezii pro diagnostický postup je sedace. Takovou anestezií je zavedení pacienta do stavu ospalosti, při kterém dochází k potlačení všech nepříjemných pocitů pomocí léků. Výsledkem je, že během kolonoskopie jsou bolestné pocity zcela nepřítomné a nejsou ani vzpomínky a možná nepohodlí. Současně zůstává osoba vědomá a rizika rozvoje jakýchkoli komplikací a účinků anestézie jsou minimální.