V Estonsko byla vytvořena nepřerušená letecká komunikace jak s regiony v rámci své země, tak s mnoha světovými městy a velkými městy. Některá letiště v Estonsku mají sovětskou minulost, po opuštění struktury Unie byly administrativní budovy, přistávací dráhy, letadla a vozové parky opakovaně aktualizovány a rekonstruovány v souladu s moderními normami.
Moderní Estonsko slouží pěti letištím, z nichž tři jsou mezinárodní. Vzhledem k tomu, že země má přístup k Baltskému moři, Finsku a Rumunsku Rižský záliv , v jeho složení jsou ostrovy Saarema a Hiiumaa, pak jsou nutné pravidelné lety spojující ostrovy s kontinentem.
Estonská mezinárodní letiště splňují všechny normy pro přijímání a údržbu dálkových letů. Estonská letecká navigační služba je plně vlastněna státem a striktně sleduje bezpečnost a kvalitu služeb pro cestující.
1. Letiště Tallinn . Největší letiště v zemi je hlavním letištěm Tallinn - Iulemiste. To se nachází v okraji města, jen 4 km od centra města. Poprvé byla otevřena a uvedena do provozu v roce 1936, od té doby byla zorganizována řada rekonstrukcí a v roce 2009 byla zcela obnovena a poté se stala jedním z několika významných letišť v Evropě. Po finální rekonstrukci získalo letiště oficiální status mezinárodního letiště Estonska, které bylo pojmenováno po jednom z prezidentů země - Lennart Mary.
Nedaleko od Yulemiste je hlavním přístavem země. Letiště má takové rozlišovací vlastnosti:
S letištěm ulemiste je veřejná doprava, takže autobusy 2 a 65 se snadno dostanete do centra města.
2. Letiště Tartu . Tartu je druhé největší město v Estonsku. Městské letiště bylo postaveno v roce 1946 u vesnice Yulenurme, a proto je stále neoficiálně nazýváno jménem této osady. To se nachází 9 km od centra města Tartu.
Po dlouhé době poté, co Estonsko ustoupilo ze SSSR na letišti v Tartu, neexistovaly žádné pravidelné lety, bylo považováno za další mezinárodní letiště v Estonsku. Po roce 2009 pravidelné lety Flybe Nordic do Finska šestkrát týdně z jeho území.
Nový terminál pro cestující Yulenurme byl postaven v roce 1981 a již v roce 2005 byl terminál přepracován a délka přistávací dráhy se zvýšila o 1800 m.
Nedaleko letiště Tartu je estonská letecká akademie.
3. Letiště Pärnu . Letiště se nachází v malé vzdálenosti od města Pärnu, bylo postaveno v roce 1939. Po vstupu Estonska do SSSR bylo letiště Pärnu používáno jako vojenské letiště. Ale od léta 1992 se nově zformované estonské ministerstvo obrany rozhodlo převést letiště pro potřeby civilního letectví. Do roku 1997 proběhla rekonstrukce dráhy a administrativních budov.
Dnes se letiště Pärnu dopouští pravidelných letů uvnitř země a mezinárodní komunikace se Švédskem, přičemž každoročně přijímá lety do Štoklandu.
4. Letiště Kuressaare . Estonské letiště Kuressaare servíruje vnitrostátní lety, nachází se na ostrově Saaremaa. Jeho oficiální otevření bylo v roce 1945, od té doby se postupně prováděla rekonstrukce. Současná budova terminálu pro cestující byla otevřena v roce 1962. Dnes Kuressaare vyrábí pravidelné odlety, které spojují ostrov s hlavním městem státu, a také během turistické sezóny obnovuje lety na estonský ostrov Ruhnu.
5. Letiště Kärdla . Letiště Kärdla leží na druhém největším estonském ostrově Hiiumaa, nedaleko města Kärdla se stejným názvem. Bylo otevřeno v roce 1963 a aktivně cestovalo Tallinn , Tartu , Vormsi, Haapsalu , Kaunas, Murmansk a Riga . Po akvizici Estonsko nezávislost, letiště Kärdla výrazně snížilo počet letů. Dnes tento letecký terminál funguje hladce a pravidelně, přičemž lety z Tallinnu.